Чтобы смягчить lockfile problem, пока не найду подходящее решение, я хотел бы проинструктировать LSF поставить не более одного из моих заданий на хост. -x flag гарантирует, что моя работа имеет эксклю
Представьте меня LSF файл как fllows: #!/bin/sh
#BSUB -J X
#BSUB -o X.out
#BSUB -e X.err
...
После его запуска на выходе будет отображаться в текущей папке. Теперь представьте себе, я нахожусь в
Спасибо за прекрасный инструмент для трубопроводов! У меня есть конвейер, который отлично работает в командной строке (snakemake -l --snakefile snakemake_example/sankefile_test9.txt). Я хотел бы иметь
я писал сценарий для представления параллельных заданий в кластере с помощью команды bsub while read p; do
cd $(echo $p | tr -d '\r')
echo Submitting test: $p
bsub -P <project> -Jd <job