Коэффициент инбридинга/алгоритмов/генотипов

Question

Я ищу хороший псевдокод - или еще что-то, но фактические фрагменты кода - при внедрении алгоритма алгоритмов в базе данных генеалогии У меня есть овец, хранящихся в базе данных SQL Server.

У меня очень старая программа на C, которая работала против плоского текстового файла, пока население не стало настолько велико, что алгоритм сломался - так как все было сделано в памяти, поэтому предпочтительной будет реализация с базой данных ...

Кто-нибудь видел что-нибудь подобное, на что они могут меня навестить?

Answer 1

Если вы не хотите откатывать свои собственные, вы можете использовать Python pypedal package для calculating the inbreeding coefficient, который supports SQL databases.

Код Pypedal для вычисления коэффициента инбридинга - here.