Использование Ruby для построения гистограммы из хэша

Question

Мне интересно отображать гистограмму (вывод, аналогичный matplotlib, а не только текстовую версию ASCII) из хэша в Ruby. Каждая хеш-клавиша должна отображаться как «метка» каждого бункера с соответствующим значением каждой клавиши, частота (ось y). Я попытался использовать «rinruby», но после нескольких попыток программа зависает. Я использую машину Windows и JRuby 9.1.0.0. Gnuplot gem был довольно запутанным, поэтому мне было интересно, может ли кто-нибудь предложить конструктивное предложение. Обратите внимание, что это не домашнее задание.

# Import the 'bioruby' package 
require 'bio' 

# Construct a new hash object referenced by the variable 'aaf' 
aaf = Hash.new(0) 

# Construct a new array object referenced by 'aa' 
aa = [] 

# Prompt the user for a file name. Wrap the user input code in 
# an exception handling block to create a more "robust" solution 
begin 
    print 'Please enter a file name: ' 

# Read the keyboard input as a string and remove the newline character. 
# The input is summarily referenced by the 'filename' variable 
    filename = gets.chomp() 

# Display a blank line for formatting purposes 
    puts() 

# Open and read the file name provided and remove the newlines from the 
# sequence file. 
    seq = File.new(filename, 'r').read().chomp() 

# Catch the exception thrown above, display the string, and return 
# control to the 'begin' block for additional user input 
rescue 
    puts "I'm sorry. I was unable to locate that file." 
    retry 
end 

# Create a new sequence object using the DNA sequence data obtained 
# from the file name provided 
seq = Bio::Sequence::NA.new(seq) 

# Use the 'translate.names' method in the bioruby package to obtain 
# the complete name of each amino acid in the 'seq' object and reference 
# them via the 'aa' object 
aa = seq.translate.names 

# Iterate/Loop over each amino acid name in the 'aa' array object using 
# 'name' as a temporary variable. The name of each amino acid is 
# associated with the frequency of occurrence. Example: 'Lysine 110' would 
# indicate that 110 Lysine residues were contained in the original 
# sequence file. 
aa.each { |name| 
    aaf[name] += 1 
} 

# Iterate/Loop over the newly populated hash structure while ignoring 
# any line (key) that is a blank line (/^$/ is a regular expression anchor 
# pattern that checks for the beginning, '^', and end, '$', of a line. The 
# line (key) is blank if the 'if' statement returns a boolean result of true. 
# A blank line in this instance would indicate the presence of a stop codon. 
# Each amino acid and its respective frequency is displayed 
aaf.each do |k, v| 
    next if "#{k}" =~ /^$/ 
    print "#{k}", "->", "#{v}\n" 
end 

Спасибо.

Answer 1

Для простых диаграмм я буду использовать Gnuplot (после того, как дело with the installationgoogle for it) или ASCii диаграмм, используя рубин веб-фреймворк я буду использовать https://github.com/ankane/chartkick, которые используют Java Script, но если бы легкая вещь только с установкой самоцвет и веб браузер для получения изображения:

╭─toni@Antonios-MBP ~/learn/ruby/stackoverflow ‹ruby-2.2.3@stackoverflow› ‹1.7› ‹SBCL 1.3.5› 
╰─$ gem install googlecharts 
Fetching: googlecharts-1.6.12.gem (100%) 
Successfully installed googlecharts-1.6.12 
Parsing documentation for googlecharts-1.6.12 
Installing ri documentation for googlecharts-1.6.12 
Done installing documentation for googlecharts after 0 seconds 
1 gem installed 
╭─toni@Antonios-MBP ~/learn/ruby/stackoverflow ‹ruby-2.2.3@stackoverflow› ‹1.7› ‹SBCL 1.3.5› 
╰─$ irb 
2.2.3 :001 > require 'googlecharts' 
=> true 
2.2.3 :003 > Gchart.bar(:data => [[300, 100, 30, 200], [100, 200, 300, 10]]) 
=> "http://chart.apis.google.com/chart?chd=s:uPEf,PfuB&cht=bvs&chs=300x200&chxr=0,300,300|1,100,300" 

link to hystogram

google charts doc

Я думаю, что с ASCii диаграммы вы можете получить, идти od результаты также

require 'ascii_charts' 

irb(main):087:0> puts AsciiCharts::Cartesian.new({0 => 1, 1 => 3 , 2 => 7, 3 => 15, 4 => 4}, :bar => true, :hide_zero => true).draw 


15|  * 
14|  * 
13|  * 
12|  * 
11|  * 
10|  * 
9|  * 
8|  * 
7| * * 
6| * * 
5| * * 
4| * * * 
3| * * * * 
2| * * * * 
1|* * * * * 
0+---------- 
    0 1 2 3 4 

=> nil