R - Случайный прогноз леса не выполняется с NA в предикторах

Question

Документация (если я читаю ее правильно) говорит, что функция предсказания случайного леса дает предсказания NA, если она встречает предсказатели NA для некоторых наблюдений.

Примечание: Если объект наследует от randomForest.formula, то любые данные с НС молча исключены из предсказания. Возвращаемое значение будет содержать NA, соответственно, в агрегированных и отдельных деревьев предсказания (если требуется), но не в непосредственной близости или узловых матриц

Однако при попытке использовать функцию предсказать на наборе данных с некоторыми NA в предикторах [NA в 7 наблюдениях из 2688]. Я сталкиваюсь со следующим условием ошибки, и предсказание терпит неудачу.

Ошибка в predict.randomForest (модель, new.ds): пропущенные значения в NewData

Существует немного грязной работы вокруг, что я хотел бы избежать, если это возможно.

Я делаю/читаю что-то неправильно? Нужно ли что-то делать с предложением "inherits from randomForest.formula"?

Answer 1

Используя некоторые примеры из документации:

set.seed(1) 
x <- data.frame(x1=gl(32, 5), x2=runif(160), y=rnorm(160)) 
rf1 <- randomForest(x[-3], x[[3]], ntree=10) 
> inherits(rf1,"randomForest.formula") 
[1] FALSE 

> iris.rf <- randomForest(Species ~ ., data=iris, importance=TRUE, 
         proximity=TRUE) 
> inherits(iris.rf,"randomForest.formula") 
[1] TRUE 

Таким образом, вы, вероятно, называется randomForest без использования формулы интерфейса, чтобы соответствовать модели.