изменение FASTA заголовки содержат счета данные

Question

У меня есть файл с несколькими рядами так:

фг-000001 ATGGATGACCGATGCTAGC 34 23 33 45 34 23 34 35 34 35 56 47

я бы чтобы преобразовать его просто FASTA файл с суммой информации счета вместе с именем в основном Fasta файл

фг-000001_x433 ATGGATGACCGATGCTAGC

Возможно ли это? Спасибо заранее!

Answer 1

Этот awk скрипт должен делать то, что вы спрашиваете:

awk '{sum=0; for (i=3; i<=NF; i++) {sum += $i}; print $1"_x"sum, $2}' file