bioperl

3зной

1ответ

как Run 'Build installdeps' установить отсутствующие предпосылки

Попытка запустить файл Build.PL и получить следующий, и не редкость, сообщение об ошибке: Checking prerequisites... build_requires: ! Test::Most is not installed recommends: * HTML

-1зной

2ответ

i wan, чтобы заменить имя последовательности в файле fasta с другим именем

У меня есть один файл fasta и один файл файла fasta содержит последовательности в формате fasta, а текстовый файл содержит имя генов, теперь я хочу заменить имя последовательностей в fasta файла после

-1зной

2ответ

Загрузка файла последовательности с perl

Я пытаюсь загрузить файл последовательности из базы данных банка генов, используя perl, но он показывает ошибку. У меня нет руководства по исправлению моей программы. Может ли кто-нибудь помочь мне в

1зной

1ответ

Bioperl и Samtools

Как запустить «mpileup» с помощью Bioperl? При попытке запустить mpileup с помощью Bio :: Tools :: Run :: Samtools, я получаю «mpileup», не зарегистрирован. Что я делаю не так? Любые указатели в прави

1зной

1ответ

Perl как улавливать сразу два исключения

Я разбираю большой файл EMBL (> 1G) и преобразовываю его в файл gff. У него есть некоторые записи, которые не соответствуют традиционному формированию эмбрионов, поэтому модуль bioperl генерирует искл

1зной

1ответ

Экспорт последовательностей в быстрый формат fasta

Я пытаюсь экспортировать выровненные последовательности в файл fasta один за другим, используя Bio::SeqIO. В результате последовательности разбиваются на новую строку каждые 60 столбцов. Как этого изб

0зной

1ответ

Попытка пользовательского сортировки филогенетического дерева в BioPerl приводит к ошибке «неопределенного значения» или «ошибки без исправления»

У меня есть филогенетическое дерево, которое я загружаю в BioPerl. Я хочу использовать пользовательскую функцию сортировки (далее «$ depth_sort»), чтобы упорядочить узлы по вертикали при печати дерева