Мои симптомы похожи на: How to create JNDI context in Spring Boot with Embedded Tomcat Container Я создал GitHub репо воссоздавать мой вопрос: https://github.com/Rkiouak/spring-boot-embedded-tomcat-hi
Я использую Spring boot 1.2.3 со встроенным tomcat 8.0.20. В обычном tomcat мы можем настроить диспетчер транзакций в контексте. Пример: <Transaction factory="com.atomikos.icatch.jta.UserTransactionFa