genomicranges

0зной

1ответ

Применение пользовательской функции data.table по строке возвращает неверное количество значений

Я вроде новой для data.tables и у меня есть таблица, содержащая геномную ДНК координат, как это: chrom pause strand coverage 1: 1 3025794 + 1 2: 1 3102057 + 2 3: 1 3102058 + 2

r data.table genomicranges 2017-01-10

---

0зной

2ответ

Получить определенный диапазон, которые перекрываются

У меня есть два dataframes: cnv_1 chr start end 3 62860387 63000898 12 31296219 31406907 14 39762575 39769146 19 43372386 43519442 19 56419263 56572829 cnv_2 chr start end 6 30994163 3099507

r dataframe overlap iranges genomicranges 2016-12-01

---

0зной

1ответ

Связанные средние значения над окном GRanges

Я пытаюсь найти среднее значение по определенному окну мета столбца объекта GRanges. Так у меня есть объект данных: > gr.data GRanges object with 10505026 ranges and 1 metadata column: seqnames

r genomicranges 2016-12-01

---