hpc

0зной

1ответ

makeMPIcluster под TORQUE: Недостаточно доступных слотов

Я использую HPC с TORQUE/MOAB/RHEL 6.7. Соответствующие строки в jobscript PBS являются #PBS -l nodes=1:ppn=8,mem=12gb module load r_3.2.0 module load icc_14.0.3-ompi_1.8.3 mpirun -np 1\ --mca

r mpi hpc torque 2015-12-13

---

3зной

1ответ

MPI_Отправить правильный способ отправки матрицы

Мне нужно использовать API MPI для матриц отправки/получения в моих программах. Для отправки матрицы я использовал ниже синтаксис: MPI_Send(matrix, ...) <- USE THIS MPI_Send(&matrix, ...) MPI_Send

c multidimensional-array mpi hpc 2015-10-31

---

-2зной

1ответ

Как запустить двоичные исполняемые файлы в многопоточном кластере HPC?

У меня есть этот инструмент под названием cgatools от complete genomics (http://cgatools.sourceforge.net/docs/1.8.0/). Мне нужно запустить анализ генома в высокопроизводительном вычислительном кластер

multithreading cluster-computing bioinformatics hpc pbs 2015-12-21

---

0зной

1ответ

Результаты BatchJobs дают результат функции * -1 + job #?

Я использую минимальный пример с использованием BatchJobs, и результаты не так ожидаются. Я использую global_config settings, с debug = TRUE. Я бегу следующий код в R на моем сервере HPC: library(Batc

r parallel-processing hpc lsf 2015-11-07

---