skbio

2зной

2ответ

Почему «sklearn.manifold.MDS» случайный, когда «skcoio pcoa» нет?

Я пытаюсь выяснить, как реализовать Principal Coordinate Analysis с различными метриками расстояния. Я наткнулся на оба skbio и sklearn с реализациями. Я не понимаю, почему реализация sklearn выполняе

1зной

1ответ

Чтение из сжатого файла FASTA bz2 с использованием skbio

Можно ли читать из сжатого файла (например, FASTA bz2)? Обычно я использую skbio.sequence.Sequence.read, но не вижу этого варианта. Спасибо!