vegan

0зной

1ответ

cca using vegan: no unconstrained инерция

Выполняю анализ CCA с использованием вегана с 7500 сайтами, переменной 9 видов и 5 переменных. Результаты > Call: cca(sitspe = Yp, sitenv = Xp) Inertia Proportion Rank Total Constrain

0зной

1ответ

Воспроизводящие результаты от Ordistep

Относительно новый для R и первый раз, так что извиняюсь, если в моем вопросе чего-то не хватает. Я использую функцию Vegan ordistep для выбора переменных, используя метод «обоих» по умолчанию. Я испо

0зной

1ответ

ggplot2 для вращения прокруток в вегане

Я хочу построить прокрутки вращения между RDA-объектами, полученными веганом с ggplot2. library(vegan) #perform two RDAs, do procrustes: pro.test <- procrustes(rda.t1,rda.t2) Я извлек координаты x

1зной

1ответ

Количественное определение переменных в каноническом анализе соответствия с использованием R? (x-post from researchgate)

В настоящее время у меня есть данные о численности видов для нескольких озер, а также измерения некоторых переменных окружения этих озер. Я решил сделать канонический анализ корреспонденции данных в R

0зной

1ответ

Ярлык Ordihull с одним окном

Я хотел бы нарисовать goups для моего рукоположения, используя функцию ordihull в вегане. Тем не менее, у меня есть несколько сайтов, имеющих только одно событие. Используя ordihull, эти сайты не отоб

3зной

1ответ

Barplot with SError из таблицы

Я пытаюсь построить сгруппированные штриховки из таблицы, которую я сгенерировал, внизу. Group.1 S.obs se.obs S.chao1 se.chao1 Cliona celata complex 499.7143 59.32867 850.6860 65.16366 Cliona vi

1зной

1ответ

Кластер UPGMA в R с значениями NoData

У меня есть матрица сайтов. Я хочу разработать агломерационный кластер UPGMA. Я хочу использовать R и библиотеку vegan для этого. В моей матрице есть сайты, в которых измерялись не все переменные. Пос

-1зной

1ответ

Создание ряда видов/отдельных лиц по образцовой таблице?

У меня есть огромная матрица обилия как data.frame (пример ниже) в R, из которой я хочу вывести простую таблицу с количеством присутствующих видов (Otu00001 и любой Otus с более чем 1 приписываемой по