Моя конечная цель - сделать сюжет, который объединяет тепловую карту и филогенетическое дерево. Я выполнил Heatmap, и я также нашел пакет ETE2 в BioPython, который мог бы помочь мне объединить два типа графиков, однако для ETE2 требуется формат Newick (подобный дереву), а не матрица расстояния (которая у меня есть) в качестве входных данных. Кто-нибудь знает модуль в BioPython, чтобы помочь мне сделать это?Преобразование матрицы расстояний в формат Newick
3
A
ответ
1
Похоже, что в Biostars есть thread. Что указывает на answer для преобразования этих форматов, а затем после this discussion списка рассылки ETE.
Я нашел this converter онлайн, я не уверен, что он работает на вас.
Просить, чтобы найти инструмент offtopic, и я только что сделал исследование Google ...