Ошибка в champ.lasso пакета Champ Bioconductor для анализа метилирования 450k

Question

Я только что установил ChAMP и все его зависимости для анализа метилирования 450k.

Я попробовал учебник (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ChAMP/inst/doc/ChAMP.pdf), но получил ошибку.

При запуске зонда Lasso DMR Хантер, я сталкиваюсь «Вы обнаружили 4161 значимые MVPs с BH скорректированной P-значения ниже 0,05 Ошибка в [.data.frame (dmr.beta.means,, 22:24,): не определено выбранные столбцы "

Ошибка предотвращает анализ анализа, и я не могу воспроизвести то, что показано в вышеупомянутом учебнике.

Я попытался удалить и переустановить CHAMP, но безрезультатно ...

Любые советы и понимание будет высоко ценится! Заранее спасибо!

Answer 1

с использованием R 3.1.0, ошибка может быть решена.