genetics

-1зной

1ответ

найти минимум функции математики с генетическим алгоритмом в MATLAB, я знаю, есть набор инструментов MATLAB для GA, но я хочу achive его programmically)

find minimum of math function with genetic algorithm in matlab Каких изменений необходимы в этом файлы-main.m? global population; global fitness; global popsize; format bank; popsize=50; report=z

-2зной

2ответ

snp к картированию генов с наименьшим значением p

Я делаю snp для картирования генов и после сопоставления с 50 kb snp, у меня есть следующий файл. например (SNP, ген, p-значение) 1. ars113 ap1 0.1 2. ars113 ap1 0.1 3. ars113 ap1 0.2 4. ars113 ap1

1зной

1ответ

Как использовать r bioconductor Entrez и RISmed библиотеку для получения данных, полученных от pumed, чтобы получить список публикаций или абстрактных.

Я использую эту библиотеку «RISmed», чтобы сделать какой-то запрос моего гена или белка, представляющего интерес, и выход поставляется с известным идентификатором в основном, но в большинстве случаев

0зной

1ответ

Добавить имена генов в dataframe, объединить 2 dataframes в столбце идентификатора транскрипции

Мне нужно добавить столбец, содержащий имена генов, в dataframe с информацией об изометрии изоформы. У меня две таблицы. DF 1 (содержит ансамбль #s ген идентификатора, в качестве значений rownames и ч

3зной

1ответ

Как применять тест-функции генетического алгоритма

Я написал следующий код для эволюции популяции (генетический алгоритм реализации): Individual.java import java.util.Random; public class Individual { public static int SIZE = 500; private

1зной

2ответ

Транспонирование кадра данных

Я пытаюсь перенести кадр данных в R, но очень мало удачи. Кадр данных содержит эпигенетический набор данных, содержащий 300 000 сайтов CpG в первом столбце. 74 дополнительных столбца разделены между к

0зной

1ответ

Незначительное совпадение частоты аллелей?

У меня есть список SNP, что я уже получил их прокси-SNP с MAF и LD из 1000 пилотов геномов 1. Я хочу знать, когда все упоминают о сопоставлении MAF, нужно ли быть точно таким же? Например, SNP-запрос

2зной

2ответ

Заменить значение и добавить строки с помощью цикла if/for

Я хочу заменить Sire на новый Id, если Dam НЕ 0. А после этого добавьте новую строку каждый раз с новыми Id и Sex. Например, мне нужно заменить 0 в первой строке как s1073 и добавить новую строку в да