slurm

0зной

1ответ

Сохранить информацию о вакансиях slurm автоматически

Я ищу способ сохранить информацию о работе, предоставленную sacct, автоматически в файл. До сих пор я включил сакт-вызов в мой рабочий пакетный скрипт, но тогда состояние всегда «РАБОТАЕТ». Есть ли сп

0зной

1ответ

Объединение xargs parallel и mpirun

У меня есть смущающий параллельный (bash) скрипт, который работает в вычислительном кластере. Скрипт - это сценарий оболочки и не, связанный с любой библиотекой MPI: это означает, что единственный спо

0зной

1ответ

SLURM Работы массив выходной файл в команде

У меня есть список команд, как этот bedtools intersect -a BED1 -b BED2 >BED1_BED2_overlaps.txt ... с более чем 100 файлов. Вот заголовок для моего представления работы #SBATCH -t 0-08:00 #SBATCH -

1зной

1ответ

обработка списка файлов в SLURM

Я новичок в SLURM. Я хотел бы обрабатывать длинный список файлов параллельно. В частности, у меня есть скрипт для обработки одного типа ./process.sh filename Теперь я хочу, чтобы обрабатывать большо

3зной

1ответ

SLURM: Как запустить только 30 заданий только на определенных узлах?

Вам необходимо запустить, скажем, 30 заданий srun, но обеспечить выполнение каждого из заданий на узле из определенного списка узлов (которые имеют одинаковую производительность, для сравнения времени

1зной

1ответ

Как получить отчеты о распределении GPU (GRES) с использованием SLURM

Я прочитал в документах slurm, которые мы могли бы использовать (после настройки бухгалтерского учета) sacct --format="JobID,AllocCPUS,**ReqGRES**, чтобы получить статистику запросов для GRES. Я также