bioconductor

-2зной

3ответ

У меня есть матрица вызов Рез первоначально как следующее: [,1] [,2] [1,] 0 0 [2,] 0 0 [3,] 0 0 [4,] 0 0 [5,] 0 0 [6,] 0 0 [7,] 0 0 [8,] 0 0 [9,] 0 0 [10,] 0 0 У меня есть матриц

1зной

2ответ

Преобразование данных проточной цитометрии с использованием flowCore?

Я хочу знать, если кто-то знает, как сделать преобразование канала четыре (FLH 4) без использования стандартных преобразований, предлагаемых пакетом flowCore? Значения канала четыре находятся между 1

1зной

2ответ

Анализ обогащения гена

Я использовал функцию cummeRbund findSimilar(), чтобы найти 10 наиболее похожих генов для дифференциально экспрессированных генов, которые я идентифицировал с помощью Cuffdiff. Это использовало рассто

0зной

4ответ

Самый быстрый способ конвертировать/обновлять идентификаторы генов в таблице?

ПРИМЕЧАНИЕ. Я не задаю вопрос, специфический для Bioconductor, но мне нужен Bioconductor в примере кода. Потерпите меня, пожалуйста. Привет, У меня есть несколько вкладок с разделителями файлов, содер

2зной

2ответ

Невозможно получить доступ к списку GSM в GEOquery R

Я работаю с набором GSE, который содержит 2 серии матриц и хотел бы скрывать все это до набора выражений, чтобы я мог работать с ним в Limma. Я загрузил GSE с помощью следующей команды: > gse <- getGE

5зной

3ответ

Показать все строки в выпуске пакета GenomicRange

Я работаю с пакетом GenomicRange R. У меня есть входной файл, как это: dvex108056 + 87 206 dvex108056 + 87 226 dvex108056 - 101 240 dvex108056 - 104 240 dvex108056 - 59 188 dvex108056 - 68 197 d

0зной

1ответ

Построение подмножеств объекта AffyRNAdeg {affy} с сюжетом AffyRNAdeg?

library(affy) microarrays <- ReadAffy() # 98 CEL files are read into the same object RNAdeg <- AffyRNAdeg(microarrays) Теперь я хочу, чтобы построить подмножества RNAdeg plotAffyRNAdeg(RNAdeg[.

2зной

1ответ

Как использовать биокондуктор из rpy2?

Я пытаюсь использовать bioconductor (конкретно seqLogo) из rpy2. Я нашел полезный пакет: http://pythonhosted.org/rpy2-bioconductor-extensions/index.html однако, когда я пытаюсь это из документации пак