bioconductor

1зной

1ответ

Как преобразовать список идентификаторов зонда agilent в символы генов с использованием biomaRt и иметь значения na?

Я пытаюсь использовать biomaRt для преобразования списка более 90k идентификаторов зондов в символы генов, но у меня проблемы. Используя функцию getBM, я вижу, что только 22k из них имеют соответствую

2зной

1ответ

Как установить прокси в R (убунт)

Gaurav Пандей Я использовал команду Sys.setenv(http_proxy="http://myusername:[email protected]:port") и работал первым. Но при перезапуске его в терминале он показал следующее error.- cannot open: H

1зной

1ответ

Аннотация Трек в Гвизе

Кто-нибудь имеет опыт использования пакета bioconductor: Gviz умеет добавлять AnnotationTrack прямо на DataTrack? Например, в ggplot2 я могу добавить к prexitsting сюжета с помощью + geom_text, но я н

0зной

1ответ

Перекрытие в цифрах с помощью нажимной окна просмотра

Я пытаюсь построить две фигуры на один PDF, используя этот код: ncols <- 1 nrows <- 2 grid.newpage() pushViewport(viewport(layout = grid.layout(nrows, ncols))) for (i in seq_along(chroms)) { push

0зной

1ответ

Формат данных, используемый при работе с LIMMA в R

Может кто-нибудь, пожалуйста, дайте мне небольшой пример того, какие данные микроматрицы, которые я импортирую в LIMMA, должны выглядеть, когда я импортирую их в R? Я пытаюсь расшифровать дифференциал

0зной

1ответ

CummeRbund csHeatmap: Способ настройки размеров текста идентификатора гена?

Мне было интересно, знал ли кто-нибудь о способе изменения текстовых меток гена id для тепловыделения, созданного функцией csHeatmap() в пакете R CummeRbund? Я знаю, что это объект ggplot, но я не мог

2зной

1ответ

Как использовать limma ebayes для небольших образцов? (Программирование R)

У меня есть следующие данные выражения из теста и управления, каждый из которых содержит два образца. > test <- read.table("http://dpaste.com/1059889/plain/") > control <-read.table("http://dpaste.co