dendrogram

5зной

1ответ

Цвета дендрограммы (ветка) для соответствия цветам (листьев) цветов (пакет ape)

Я пытаюсь добавить цвет к краям (линиям) графика филогения в R, используя команду plot.phylo из обезьяны пакет. Этот пример предназначен для графика типа «вентилятор», хотя я ожидаю, что подход будет

1зной

1ответ

Вырезание кластера из dendrogram

Я использую эту ссылку для создания красивой дендрограммы с цветными ярлыками в соответствии с категориями. Второй ответ, что я смотрю на в этой ссылке (Tree cut and Rectangles around clusters for a h

2зной

1ответ

отображает кластеры в радиальном формате

У меня есть список кластеров, которые можно сказать от кластера 1 до кластера 3; наряду с их членством, например, ниже. Я хотел бы отображать кластеры в радиальном формате. Я думал об использовании фу

1зной

1ответ

Как использовать определение горизонтальной дендрограммы класса «дендрограмма» в R

Я использую идентификатор для изучения особенностей кластеров в дендрограмме в R. Идентификация работает отлично, используя объект «hclust», но мне нужно это для горизонтальная дендрограмма класса 'de

1зной

1ответ

Этикетки в дендрограммы в R

Я работаю на дендрограммы plot(clust.res, hang=-1, main=dedro,labels=data1$Name.of.the.variety) Тогда сообщение, что я получаю: Warning messages: "labels" is not a graphical parameter

1зной

1ответ

Anaconda Python 3.4, используя Силовую фигуру слишком туго

Я разрабатываю иерархические кластеры в виде дендрограмм с использованием Python 3.4 и Seaborn, используя работу Ольги Ботвинник (http://nbviewer.ipython.org/gist/olgabot/bfe1e3638af3eea52fb1#). Моя ц

0зной

1ответ

R hclust -> dendrogram -> phylo?

У меня есть иерархические объекты кластера hclust с сотнями узлов и длинными ярлыками. Например, синонимы множественных генов в семье. Смотри ниже. Я хотел бы нарезать hclust на более мелкие поддеревь