phylogeny

0зной

1ответ

Филогенетика в R: разные результаты при работе по дереву по сравнению с чтением его в

Этот вопрос непосредственно вытекает из предыдущей, я спросил здесь: Phylogenetics in R: collapsing descendant tips of an internal node ((((11:0.00201426,12:5e-08,(9:1e-08,10:1e-08,8:1e-08)40:0.004030

r tree phylogeny 2016-07-27

---

0зной

1ответ

Цвет кончиков филогенетического дерева по видам человека

Я пытаюсь построить филогенетическое дерево с начальной загрузкой с использованием методологии, определенной here. Построение имени каждого человека (названное 1,2,3,4, ... для этих примеров) не являе

r tree bioinformatics phylogeny ape 2016-09-30

---

1зной

1ответ

Как преобразовать дерево, нарисованное с помощью ete2 в формат Newick?

Я нарисовал дерево в python, используя команды ete2 Tree(), .add_child(), .add_sister() и так далее. Есть ли способ преобразовать это дерево в соответствующий формат Newick?

python tree phylogeny etetoolkit 2016-06-29

---

0зной

2ответ

Добавление символов и информации в филогенетическое дерево

Я рисую филогенетическое дерево, и я хотел бы добавить что-то вроде «мертвого символа» (например, черепа) в кончиках вымерших видов. Я также хотел бы добавить строку осей x с латексными символами во в

r phylogeny ape 2016-10-15

---