dendrogram

1зной

1ответ

Настроить ось x с помощью JfreeChart XYLineChart

Я показываю результаты операции кластеризации на XYLineChart с использованием JFreeChart. Пока сюжет я получаю это: мне нужно изменить ось х, чтобы получить этот экран: Поэтому в основном я в первую о

-1зной

1ответ

Ограничить ось y на диаграмме R dendrogram

Я хотел бы ограничить ось y на графике дендрограммы в R. Теперь у меня есть ось y от 1 до 3000. Правильная ли функция для достижения этого ylim? Как я должен это делать? plot(fit, main = 'Dendrogram',

2зной

1ответ

Маркировка вертикальных и горизонтальных дендрограмм

Я новичок в R, и я пытаюсь построить горизонтальную и вертикальную помеченную дендрограмму с помощью dist() и hclust(). Я построил шесть разных типов, но не могу добавить ярлыки. Спасибо, если у кого

21зной

4ответ

Участок дендрограммы с использованием sklearn.AgglomerativeClustering

Я пытаюсь построить дендрограмму с использованием атрибута children_, предоставленного AgglomerativeClustering, но пока мне не повезло. Я не могу использовать scipy.cluster, поскольку агломеративная к

3зной

3ответ

Как покрасить метки дендрограммы в соответствии с определенными группами? (in R)

У меня есть числовая матрица в R с 24 строками и 10 000 столбцов. Имена строк этой матрицы - это в основном имена файлов, из которых я прочитал данные, соответствующие каждой из 24 строк. Кроме этого

4зной

3ответ

R разрезать дендрограмму на группы с минимальным размером

Есть ли простой способ рассчитать самое низкое значение h в cut, которое производит группировки заданного минимального размера? В этом примере, если бы я хотел кластеров, по крайней мере, десять челов

5зной

2ответ

Как окрасить ветви и тикать этикетки в тепловой карте.2?

Я сделал карту тепла, используя функцию heatmap.2 из gplots в R, но у меня нет идеи о том, как окрашивать ветви и тикать метки на группы (например, если я разрежу дерево, чтобы иметь четыре gruops, на

1зной

3ответ

Использование R для кластера на основе эвклидовой дистанции и полной метрики связи, слишком много векторов?

Я пытаюсь понять, как читать в матрице счетчиков в R, а затем кластер на основе эвклидова расстояния и полной метрики связи. Исходная матрица имеет 56 000 строк (генов) и 7 столбцов (обработки). Я хоч