dendrogram

1зной

1ответ

Назовите и покрасьте имя каждого экземпляра разного цвета с помощью Deprogram в R

Может кто-нибудь мне помочь, пожалуйста? Я пытаюсь провести дендрограмму с использованием матрицы расстояния ДНК, используя следующий код. Все кажется прекрасным, но я, кажется, не могу иметь каждого

1зной

1ответ

Как создать дендрограмму с курсивом

Итак, я пытаюсь создать дендрограмму из 42 разных генов на основе матрицы расстояния. Эта цифра была создана с: d6 = расстояние (т (cildata)) HC6 = hclust (d6) участок (HC6) Я тогда просто спас, что с

2зной

1ответ

Измерение надежности дерева/дендрограммы (Traminer)

Я провел анализ с использованием TraMineR, чтобы измерить сходство между последовательностями пространственного использования (например, Rural (R) vs Urban (U): пример последовательности -> RRRRRUUURR

1зной

2ответ

Как получить доступ к атрибутам дендрограммы в R

Из дендрограммы, который я создал с hc<-hclust(kk) hcd<-as.dendrogram(hc) я выбрал суботраслевой k=hcd[[2]][[2]][[2]][[2]][[2]][[2]][[2]][1] Когда я просто отобразили к, это дает: > k [[1]] [[1

0зной

1ответ

Иерархическая кластеризация Heatmap в python

У меня есть матрица NxM со значениями, которые варьируются от 0 до 20. Я легко получаю тепловую карту с помощью Matplotlib и pcolor. Теперь я хотел бы применить иерархическую кластеризацию и дендрогра

0зной

1ответ

группировки с помощью дендрограммы MATLAB

У меня есть матрица А, состоящая в 4 векторов (столбцы) из 12 элементов, каждый из A = [ 0 0 0 0; 0.0100 0.0100 0.0100 0; 0.3000 0.2700 0.2400 0.2400; 0.0400 0 0.0200 0.0200;

1зной

2ответ

R hclust height of final merge

При выполнении иерархической кластеризации в R с функцией hclust. Откуда вы знаете высоту финального слияния? Так уточнить с некоторыми данными R по умолчанию: hc <- hclust(dist(USArrests)) dendrogra