genbank

0зной

1ответ

BioPerl: extract CDS error

Я пытаюсь извлечь CDS и соответствующие аминокислотные последовательности из файла GenBank с помощью BioPerl. Сценарий показано ниже: while (my $seq_object = $in->next_seq){ for my $feat_object ($seq

bioperl genbank 2014-10-23

---

3зной

1ответ

Преобразование FASTA в GenBank

Есть ли способ использовать BioPython для преобразования файлов FASTA в формат Genbank? Есть много ответов о том, как конвертировать из Genbank в FASTA, но не наоборот.

biopython fasta genbank 2015-05-12

---

0зной

1ответ

Как получить научное название, учитывая код присоединения GenBank к биопитону?

Кто-то знает, как я могу получить научное имя (или все функции) из данных в GenBank, используя только присоединение кода GenBank и biopython. Например: >>> From Bio import Entrez >>> Entrez.email = [

python bioinformatics biopython genbank 2015-02-05

---

0зной

1ответ

вывести последовательность из genbank formt

Этот код работал правильно, но теперь он жалуется, изменилась структура genbank? #!/usr/bin/perl -w #use strinct ; u

perl bioinformatics bioperl genbank 2013-06-26

---