genetics

1зной

2ответ

Как преобразовать данные генотипирования

У меня есть dataframe (приблизительно dim 446664 X 234), который называется mydf (dput). Этот dataframe имеет столбцы REF и ALT. REF имеет только одну букву в каждой строке, но ALT может иметь одну, д

-1зной

1ответ

Ошибка в champ.lasso пакета Champ Bioconductor для анализа метилирования 450k

Я только что установил ChAMP и все его зависимости для анализа метилирования 450k. Я попробовал учебник (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ChAMP/inst/doc/ChAMP.pdf), но получ

0зной

2ответ

R код для работы с данными генотипа

У меня есть эти данные: mydf. мне нужно, чтобы соответствовать буквы (букв ДНК) в колонке REF и ALT с colnames(x) ("A","T","G","C") и получить соответствующие числовые значения, вставленные вместе "RE

-1зной

3ответ

Переупорядочить строки в алфавитном порядке и в порядке

У меня есть список в цикле for, и он использует itertools.product(), чтобы найти разные комбинации букв. Я хочу использовать collections.Counter() для подсчета количества вхождений элемента, однако, с

0зной

2ответ

Обратная дополнительная база

Я новичок в программировании R, и я пытаюсь написать программу для Reverse and Additional Supplement Base. Целью является разработка ДНК-праймера. Таким образом, у меня есть последовательность ДНК с о