genetics

2зной

3ответ

Извлечь символ вокруг символа в R

Я хотел бы выделить символ вокруг символа, используя R и sub. Я пробовал много регулярных выражений, но я не получаю то, что хочу. Мой вектор: c("G>GA", "T>A", "G>A", "G>A", "A>T", "CT>C", "T>C", "T>C

regex string r genetics 2014-01-13

---

7зной

5ответ

Дополнить последовательность ДНК

Предположим, у меня есть последовательность ДНК. Я хочу получить его дополнение. Я использовал следующий код, но я его не понимаю. Что я делаю не так ? s=readline() ATCTCGGCGCGCATCGCGTACGCTACTAGC p=

r replace bioinformatics genetics complement 2013-12-04

---

1зной

2ответ

Методика кроссовера в генетическом алгоритме

Я в процессе написания небольшой генетической схемы алгоритма в C++. Мои хромосомы кодируются как битовые строки, где каждый ген имеет заданный размер. Каждая хромосома хранит свои гены один за другим

c++ genetic-algorithm genetic-programming genetics 2013-12-05

---

1зной

1ответ

Организация базы данных MySQL

Мне нужно создать новую таблицу в моей базе данных. От формы, я собираюсь отправить информацию в базу данных: -Gene name -Chromosome -Sequence -Organism С другой стороны, у меня есть еще одна таб

mysql organization genetics 2013-12-13

---

1зной

1ответ

Поиск перекрывающих областей хромосомы с помощью GRanges

У меня есть список диапазонов геномных областей, полученных из серии пациентов. > head(dotoo) GRanges with 6 ranges and 3 metadata columns: seqnames ranges strand | Id CN Histology <

r overlap genetics 2013-12-13

---

0зной

1ответ

Внедрение алгоритма Витерби в HMM с изменяющимися матрицами излучения по маркетам геномики

Я хотел бы попросить о помощи в реализации скрытого подхода марков к назначению родословной на основе данных генотипа SNP. Учитывая, что у меня переход матрица генерируется как таковую: states <- c("A

r stat hidden-markov-models genetics viterbi 2013-11-18

---