pysam

0зной

1ответ

Обновление версии программного обеспечения в Anaconda

Я установил python и многие другие полезные инструменты на своем Ubuntu 14.04, используя Anaconda. Я установил pysam (htslib интерфейс для Python), используя conda install pysam Однако это устанавли

anaconda conda pysam 2015-12-11

---

14зной

2ответ

Как кэшировать чтения?

Я использую python/pysam для анализа данных последовательности. В его учебнике (pysam - An interface for reading and writing SAM files) для команды mate сказано: «Этот метод слишком медленный для обра

python caching bioinformatics samtools pysam 2015-12-16

---

1зной

1ответ

Доступ к файлу Bam в определенном месте с использованием Pysam

У меня есть номер и местоположение хромосомы (chr1 и location 1599812). Я хочу использовать pysam-модуль python для доступа к файлу bam, чтобы получить информацию о номерах считывания только для опред

python bioinformatics python-module biopython pysam 2015-06-07

---

1зной

1ответ

Сообщение об ошибке при использовании многопроцессорной обработки Python

Мне нужно преобразовать очень большой файл .bam в .bed-файл, хотя я нашел решение, используя параллельные параллельные параллельные параллельные параллельные SEG и gnuParallel, для двух кластеров я мо

python parallel-processing multiprocessing pysam 2015-08-06

---

2зной

1ответ

Ошибка при установке samtools для python на windows

Я пытаюсь установить модули pysam и pybedtools на python 3.4. Но у меня есть Ошибка: Collecting pysam Using cached pysam-0.9.0.tar.gz Complete output from command python setup.py egg_info:

python pysam 2016-04-22

---