dna-sequence

3зной

1ответ

Как рисовать круговые диаграммы в haploNet Haplotype Networks {pegas}

Я пытаюсь использовать функцию haploNet {pegas} для построения сети гаплотипов, но у меня возникли проблемы с установкой равных гаплотипов из разных групп населения на одном и том же пике. Я могу пост

r dna-sequence phylogeny genetics ape-phylo 2014-09-10

---

1зной

4ответ

Могу ли я использовать типы данных, такие как bool, для сжатия данных и улучшения удобочитаемости?

Мой официальный вопрос будет: «Существует ли чистый способ использовать типы данных для« кодирования и сжатия »данных, а не с использованием маскирования грязных бит». Надежды состоят в том, чтобы сэк

c++ compression bigdata entropy dna-sequence 2014-09-18

---

-1зной

1ответ

Ошибка программы Perl

Я написал программу PERL, которая берет лист excel (прикрывается текстовым файлом, изменяя расширение с .xls на .txt) и файл последовательности для его ввода. Лист excel содержит начальную точку и кон

perl fasta dna-sequence blast 2014-09-19

---

1зной

1ответ

Назовите и покрасьте имя каждого экземпляра разного цвета с помощью Deprogram в R

Может кто-нибудь мне помочь, пожалуйста? Я пытаюсь провести дендрограмму с использованием матрицы расстояния ДНК, используя следующий код. Все кажется прекрасным, но я, кажется, не могу иметь каждого

r dendrogram dna-sequence phylogeny dendextend 2014-09-19

---

1зной

1ответ

Энтропия последовательности файлов MEME в формате PWM?

Предпосылки: У меня мотивы ДНК в MEME file format представлен в виде position-weight-matrices (PWMs). Ниже приведен пример из Here (также см. Here). MOTIF c585_n005_AGCWTAATC_d_0.034 letter-probabil

dna-sequence 2014-09-23

---

0зной

1ответ

Свернуть список DNAstringsets в один DNAStingset, чтобы применить writeXStringSet() и превратить его в файл fasta в R

Использование R для биоинформатики здесь: У меня есть список DNAstringsSets (см. Ниже) и вы хотите использовать writeXstringset(), которая берет объект DNAstringset в качестве аргумента для сохранения

r fasta dna-sequence 2014-10-10

---

-5зной

1ответ

Как извлечь уникальную строку символов из строки текстового файла?

У меня есть большой текстовый файл кто есть строки состоят в следующем формате: Query: 1586 cccaagatgagctgcagccccccagagagagctctgcacgtcaccaagtaaccaggcccc 1645 Sbjct: 27455708 cccaagatgagctgcagcccccca

python text extract dna-sequence 2014-10-12

---