fasta

0зной

1ответ

Марк дубликатов заголовков в файле fasta

У меня есть большой файл Fasta, который я хочу изменить. Он в основном состоит из множества последовательностей с заголовками, которые начинаются с «>». Моя проблема в том, что некоторые заголовки не

awk sed duplicates fasta 2016-01-13

---

0зной

1ответ

BioPython: IOError: [Errno 2] Нет такого файла или каталога

Я пытаюсь преобразовать файл FASTQ (сгенерированный из файла последовательности Illumina Miseq сопряженного генома) в FASTA и в конечном итоге преобразовать его в Genbank с использованием аннотированн

python biopython fasta fastq 2015-11-28

---

0зной

3ответ

Slow Баш скрипта для выполнения патча в выражении в каждой строке входного файла

У меня есть простой Баш скрипт следующего #!/bin/bash #This script reads a file of row identifiers separated by new lines # and outputs all query FASTA sequences whose headers contain that identifie

bash parsing sed fasta 2015-12-08

---

0зной

2ответ

Обходной путь для индекса за пределами диапазона при поиске по файлу FASTA

Я работаю над программой, которая позволяет пользователю вводить последовательность, которую они хотят найти в файле FASTA, после чего программа показывает строку описания и последовательность, котора

python for-loop nested-loops fasta 2015-12-12

---