phylogeny

0зной

1ответ

Я пытаюсь редактировать метки меток в файле phyloxml, так что они состоят всего из 4 цифр. Например, то, что я сейчас называю в файле phyloxml, - это идентификаторы слева. То, что я хочу, являются иде

2зной

1ответ

Расстояние между видами в открытом Древе Жизни

Приветствия и Приветствие, Я пытаюсь найти относительное расстояние до других видов в открытом Древе Жизни (OTOL). Я использую функцию R пакета fastDist() для генерации счета между ветвями дерева. Тем

2зной

1ответ

Как использовать категориальные векторы в ape (r) для филогенетических независимых контрастов

Я выполнял филогенетически независимые контрасты нескольких экологических переменных для филогенеза кошки, используя пакет ape в R, и мне было интересно, как это можно сделать, используя категориальны

0зной

1ответ

R Помогите создать дерево для MiRKAT

Я пытаюсь создать дерево для использования с пакетом Mi MiRKAT, но поскольку документация очень трудно понять, я надеюсь, что кто-то здесь может мне помочь. Мои данные в структуре: Acaryochloris Ach

2зной

1ответ

ggtree change radius scale

Я пытаюсь создать филогенетическое дерево с ggtree. У меня возникают проблемы с изменением размера центра дерева, чтобы символы на краю, представляющие мои последовательности, не перекрывались и увели

0зной

1ответ

Как создать парную матрицу с временами ветвления?

Мне нужно сделать очень простую вещь, у меня есть дерево с ветвящимися временами (называемое внутри объекта подобно длине ветви), и мне нужно создать матрицу со временем ветвления для подсказок. Я про

1зной

1ответ

Разный цвет для разных кластеров в дереве с использованием пакета adegenet R

Я использую пакет R adegenet, чтобы построить соседнее дерево соединения. В моем файле у меня 20 000 столбцов и 500 строк. Строки соответствуют физическим лицам. Мой первый столбец - это идентификатор