Есть другие пакеты, в частности ape для R, которые строят дерево без корня, а затем разрешают его root explicitly specifying an outgroup. Напротив, в BioPython я могу напрямую создать корневое дерево
Я использую пакет Phylo от Biopython для создания филогенетических деревьев. Для больших деревьев, мне нужно уменьшить FontSize узлов листа. Было предложено изменить matplotlib.pyplot.rcParams [ «font
Я хочу изменить имена в файле phylip, используя информацию из другого файла. Филип - это только одна непрерывная строка информации, и в нее встроены имена, которые я хочу изменить (например, aaaaaaaby
я получаю сообщение об ошибке при использовании модели ARD функции аса в R. Ошибка Ошибки в floating.pie.asp (XX [я] , ГГ [I], пирог [я,], радиус = xrad [I], Col = piecol): floating.pie: х значения до
Я импортировал дерево Newick в R с обезьяной (read.tree). Проблема в том, что когда я рисую дерево, метки перекрываются, потому что есть 1000 подсказок. Я не копирую дерево здесь, потому что это очень