phylogeny

1зной

1ответ

Отображение дискретных данных символа на филогении с использованием R

Кто-нибудь знает, как я могу отображать персональные данные на кончиках филогении, представленных в виде геометрических фигур разных цветов? Я ищу что-то вроде этого: http://www.plosone.org/article/in

0зной

3ответ

рисовать на филогении край с R

Я хочу, чтобы нарисовать символ (кросс) в любом месте вдоль края филогении с Р. Давайте считать, что дерево: tree.mod (((((hg19:0.0295977,macFas5:0.0351997)hg19-macFas5:0.0796862,otoGar3:0.153768)hg19

1зной

1ответ

Заказ филогенетических узлов

Я делаю некоторые графики в R, используя лингвистическую филогению. Я хочу построить ряд квадратов после терминального узла филогении и покрасить их, чтобы представить ряд переменных. Я создал квадрат

4зной

1ответ

Узел меток на круглом филогенетическом дереве

Я пытаюсь создать круглое филогенетическое дерево. У меня есть эта часть кода: fit<- hclust(dist(Data[,-4]), method = "complete", members = NULL) nclus= 3 color=c('red','blue','green') color_list=

3зной

1ответ

Как рисовать круговые диаграммы в haploNet Haplotype Networks {pegas}

Я пытаюсь использовать функцию haploNet {pegas} для построения сети гаплотипов, но у меня возникли проблемы с установкой равных гаплотипов из разных групп населения на одном и том же пике. Я могу пост

1зной

1ответ

Назовите и покрасьте имя каждого экземпляра разного цвета с помощью Deprogram в R

Может кто-нибудь мне помочь, пожалуйста? Я пытаюсь провести дендрограмму с использованием матрицы расстояния ДНК, используя следующий код. Все кажется прекрасным, но я, кажется, не могу иметь каждого

0зной

1ответ

Добавление новых узлов в дерево по dendroPy

Я хотел бы создать дерево, динамически добавляя узлы к уже существующему дереву в DendroPy уже . Так вот, как я двигаюсь, >>> t1 = dendropy.Tree(stream=StringIO("(8,3)"),schema="newick") Теперь, соз