bioconductor

1зной

1ответ

Использование R для создания таблицы из списка при сохранении атрибутов

Я пытаюсь использовать R для создания таблицы, которая связывает все идентификаторы орфографии KEGG со всеми родственными генами Entrez. Теоретически это можно сделать, используя пакет KEGGREST из био

r list bioconductor 2015-11-13

---

0зной

1ответ

R, GenomicRanges: найти ширину перекрытия диапазонов геномных

даны два GenomicRanges, как: library(GenomicRanges) gr1 <- makeGRangesFromDataFrame( data.frame( chr = c("1","1","2","2"), start = c(10,50,10,50), end = c(20,60,20,60)

r overlap bioconductor 2016-01-14

---

1зной

2ответ

Ошибка в limma - lmFit - chol2inv: 'x' должна быть квадратной числовой матрицей

Я не мог найти ответ на этот вопрос, поэтому я отправляю решение на случай, если у других будет такая же проблема. Использование пакета limma от Bioconductor, я имел следующую ошибку: > fit <- try(lmF

r bioconductor 2016-01-22

---

0зной

1ответ

Поиск координат из графика BCV в edgeR

Как узнать функцию (x) и, следовательно, координаты функции, которые генерируют график дисперсии (BCV) из пакета edgeR? Мне нужно знать «координаты» вершин (максимальное и минимальное значение для каж

r function math coordinates bioconductor 2015-12-06

---