bioconductor

0зной

1ответ

qvalue Результат запутанный, это две колонки?

Я использовал qvalue от R qvalue упаковки (биокондуктор) и наложил его на значения p 0 0, t.test. Затем я написал результат в txt-файл, но у меня было два столбца: один для pvalues, а другой для qvalu

0зной

1ответ

Как преобразовать имена генов (hgnc_symbol) в ансамбли ID в R? «bioconductor-biomaRt»

У меня есть список генов как имена ростов моего eset, и я хочу преобразовать их в ID Ensembl. Я использовал getGene в пакете bioMart, но для некоторых генов он получил то же имя! вот небольшой пример

-1зной

1ответ

Использование функции выбора R в Python с использованием rpy2

Я пытаюсь скрывать номера доступа UniProt к идентификаторам Entrez, используя пакет BioconductoR org.Hs.eg.db (который является объектом S4). Я также пытаюсь сделать это как часть скрипта Python с rpy

0зной

1ответ

Не удается установить R пакет из Bioconductor

Я пытаюсь установить RTCGA package from bioconductor но когда я следовать инструкциям установки: ## try http if https is not available source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("RTCGA")

1зной

2ответ

вычислять показания на миллион изображений, считанных с использованием R

df1 <- read.table(text=" gene_id A1 A2 A3 A4 length Total ENSMUSG00000000028 58 93 48 58 789 200 ENSMUSG00000000031 11 7 20 16 364 54 ENSMUSG00000000037 3 5 6 98

0зной

1ответ

Bioconductor DNACopy пакет ххх не доступен (для R версии 3.2.1)

Я знаю, что есть несколько подобных вопросов там, в частности, это: How should I deal with "package 'xxx' is not available (for R version x.y.z)" warning? Ответ немного подавляющим для меня, если чест