bioconductor

2зной

1ответ

Мне нужно установить 2 пакета в R, чтобы запустить другую библиотеку. При установке limma и IRanges от Bioconductor, я получаю следующее сообщение об ошибке: > install.packages("IRanges_1.18.4.tar.gz"

-1зной

1ответ

Ошибка в champ.lasso пакета Champ Bioconductor для анализа метилирования 450k

Я только что установил ChAMP и все его зависимости для анализа метилирования 450k. Я попробовал учебник (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ChAMP/inst/doc/ChAMP.pdf), но получ

0зной

1ответ

Как исправить ошибку ошибки олигонуклеотида в R

У меня возникла проблема с функцией read.fasta пакета «seqinr». Когда я использую его с лапкой, он не создает нужный вектор. Кроме того, когда я использую функцию count для вектора, созданного вручную

2зной

1ответ

R CMD предупреждение с CUDA * .cu файлы

Я строю tiny R package, который использует Rcpp и CUDA. Это учебное упражнение, помогающее мне создать более крупный пакет для представления в Bioconductor. Пакет устанавливает и работает отлично на м

1зной

2ответ

Как загрузить комплекты данных GEO для метилирования (450 тыс.) Без образца пробы?

Я скачал несколько Illumina 450k метилирования наборы данных Gene Expression Omnibus (GEO) Анализатор R Bioconductor пакеты minfi и CHAMP, кажется, требуется что-то называется «образец листа» Большинс

17зной

1ответ

Свертывание доверительных интервалов с значениями NA

Я хотел бы построить доверительные интервалы для данных с NA, используя Gviz. Я изменил ручной пример, чтобы разоблачить мою проблему. Во-первых, как руководство разоблачить: library(Gviz) ## Loadin

0зной

1ответ

Невозможно выполнить все текстовые файлы из одной папки с помощью Rscript

Это скрипт R для показателей качества массива. Первый шаг идет хорошо, но после выполнения второго шага возникает ошибка. library(arrayQualityMetrics) library(limma) library(tcltk) X <-tk_choose.