bioconductor

0зной

2ответ

Функция каретки 'train' не подходит для мешков svm

Я использую пакет биокондуктора MLSeq на Ubuntu с R версии 3.1.2. Я пробовал работать через the example provided by the package, и это работает отлично. Тем не менее, я хочу использовать метод bagsvm

-1зной

1ответ

Как отредактировать xcmsSet, сгенерированный пакетом XCMS

Из-за того, что XCMS не предлагает завернутые методы для нормализации, мне приходится выполнять нормализацию по моим собственным кодам. В целях создания нормализованного Diffreport с diffreport(), я п

1зной

1ответ

GOstats и termGraph - Получение всех графиков из списка

Я использую пакет R/Bioconductor GOstats. У меня возникла проблема, которая не связана с функцией программы только моей способностью перенаправлять вывод в Rscripts. Я запускаю процедуру под названием

0зной

1ответ

Извлечь последовательность положительных ударов из vcountPattern в R

Я провел небольшую последовательность РНК и попытался проанализировать файл результата fastq. Сначала я импортировал файл fastq в R с использованием пакета ShortRead и преобразуется в DNAstringSet rea

0зной

1ответ

Подгруппировка на графике в R

Я хочу представить данные из разных отдельных ячеек в xyplot, а затем дать им цвет в базе другой категории. Однако, когда я был в состоянии представить это с точками: xyplot(signal ~ time | as.factor(

1зной

2ответ

Как узнать, какую версию R требуется пакет.

Я попытался установить this package, который был построен с помощью Bioconductor (R): 3.1 (3.2.1). Тем не менее, я получил следующее сообщение об ошибке: Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.4

0зной

1ответ

выберите столбцы из phenoData of ExpressionSet в R

Я хочу выбрать столбцы из phenoData of ExpressionSet в R. Мои данные для процессов - teset. class(teset) [1] "ExpressionSet" attr(,"package") [1] "Biobase" teset ExpressionSet (storageMode: lock