biopython

2зной

2ответ

Ошибка при использовании NCBIWWW из biopython

Я пытаюсь взорвать нуклеотидную последовательность, используя NCBIWWW from Bio.Blast import NCBIWWW my_query = "TGCGTGCCGTGCAATGTGCGT" result_handle = NCBIWWW.qblast("blastn", "nt", my_query) blast

python biopython blast ncbi 2016-11-15

---

1зной

1ответ

XLRD/Entrez: Поиск по Pubmed и извлечение отсчетов

Я работаю над проектом, который требует от меня поискать по pubmed с использованием входов из таблицы Excel и распечатать подсчет результатов. Я использовал xlrd и entrez для выполнения этой работы. В

python xlrd biopython pubmed 2016-10-10

---

0зной

1ответ

Как напечатать предопределенную последовательность в python

Я пытаюсь напечатать предопределенную последовательность из входного файла pdb в python, но я не получаю ожидаемого результата. Я новичок в python, и у меня есть также каталог импорта, но он не работа

python python-2.7 python-3.x bioinformatics biopython 2016-10-13

---

0зной

2ответ

Как получить все записи fasta, содержащие любой список строк в заголовке

Мне нужен скрипт, который может извлекать все записи fasta из файла, который содержит любой список строк в заголовке. Так что, если у меня был список в один файл, например так: 2.A.1.13.5 3.A.1.208.2

python string search biopython fasta 2016-11-02

---